La tecnica delle coppie nascoste si basa sullo stesso approccio delle singole nascoste, ma la sua implementazione è leggermente più complessa. La tecnica prevede l'analisi delle note nelle celle.
La condizione principale: se ci sono 2 celle con note in una riga, in una colonna o in un blocco 3x3, e i numeri inscritti nelle celle non si ripetono in altre celle, possono essere considerati i candidati principali. Gli altri numeri candidati vengono cancellati.
Per rendere più facile la comprensione, consideriamo un esempio con un blocco 3x3. Se si osservano attentamente le note, si può notare che i numeri 3 e 8 ricorrono due volte e non si ripetono in nessun altro punto. Queste sono quindi le nostre coppie nascoste! Rimuoviamo tutte le altre note da queste celle, lasciando 3 e 8.
Il metodo delle coppie nascoste è considerato avanzato e viene utilizzato da giocatori esperti per risolvere livelli di Sudoku difficili. Basta imparare a utilizzare la tecnica delle coppie nascoste per risolvere Sudoku di qualsiasi livello di difficoltà.