ヒドゥン・ペア・テクニックはヒドゥン・シングルと同じアプローチに基づくが、実装はやや複雑である。このテクニックでは、セル内の音符を分析する。
主な条件：1行、1列、または3×3のブロックの中に音符のあるセルが2つあり、そのセルに刻まれた数字が他のセルで繰り返されていなければ、そのセルを主な候補とすることができる。他の候補の数字は消去される。
理解しやすくするために、3x3のブロックの例を考えてみよう。音符をよく見ると、3と8という数字が2回出てきて、他には繰り返されていないことがわかります。これが隠れたペアです！これらのマスから他の音符をすべて取り除き、3と8を残します。
ヒドゥンペアのテクニックは上級者向けで、経験豊富なプレーヤーが難易度の高いナンプレを解くときに使います。ヒドゥンペアのテクニックを身につけるだけで、どんな難易度のナンプレも解けるようになります。